eazySNP System

Klinischer und diagnostischer Nutzen:

Therapiesteuerung in Echtzeit: Der Nachweis spezifischer FKS1-Mutationen unterstützt die frühzeitige Anpassung der antifungalen Therapie.

Surveillance und Infektionskontrolle: Schnelle und spezifische Diagnostik fördern das Ausbruch‑ und Cluster‑Management und stärken Antibiotic‑Stewardship‑Programme.

Fokus auf Hochrisiko‑Szenarien: Besonders relevant für Harnwegs‑ und Kolonisationsisolate, wo niedrige Wirkstoffexpositionen häufig mit der Resistenzentwicklung verknüpft sind.

Durch den gezielten Nachweis belastbar assoziierter SNP-Varianten liefert eazySNP handlungsleitende Informationen mit unmittelbarem Mehrwert für Klinik und Labor.

Das Kit kombiniert LAMP‑Technologie mit einem CRISPR‑Cas‑basierten Nachweis und liefert die Information zur Echinocandin-Resistenz bei C. auris direkt aus einer einzelnen Kolonie in weniger als 1h. Keine aufwendige und zeit- und kostenintensive DNS-Extraktion nötig. Integrierte Qualitätsmechanismen gewähren eine valide Ergebnisanzeige.

Mithilfe eines optimierten LAMP-Primersets wird die Zielregion des betreffenden Gens (in der sich die SNP-Position in einem nichtbindenden Bereich zwischen dem FIP- und dem BIP-Primer befindet) amplifiziert.
Anschließend erkennt der Typ-III-CRISPR-Cas-Proteinkomplex mithilfe einer CRISPR-RNA (crRNA) die gesuchte Sequenz (SNP oder Insertion) mit hoher Spezifität.
Nach der Erkennung und Bindung produziert der Typ-III-CRISPR-Cas-Komplex aus Adenosintriphosphat (ATP)-Molekülen zyklisches Oligoadenylat (cOA). Das erzeugte cOA aktiviert anschließend eine RNase, ein Enzym, das eine fluoreszierende Reporter-RNA spaltet. Nach der Spaltung des fluoreszierenden Reporters kann das resultierende Fluoreszenzsignal gemessen werden.